Система менеджмента качества НПО «Наука» функционирует с 2000-го года и распространяется на деятельность по разработке, производству, реализации, испытаниям, ремонту, техническому обслуживанию, установке, монтажу продукции.
Политика в области качества одобрена руководством НПО «Наука».

Федеральное агентство воздушного транспорта (Росавиация) выдало НПО «Наука»
сертификат разработчика авиационной техники
и сертификат организации по техническому обслуживанию.
Документы удостоверяют, что НПО «Наука» соответствует Федеральным авиационным правилам «Сертификация авиационной техники, организаций - разработчиков и изготовителей. Часть 21», раздел «J» в заявленной области и Федеральным авиационным правилам «Требования к юридическим лицам, индивидуальным предпринимателям, осуществляющим техническое обслуживание гражданских воздушных судов. Форма и порядок выдачи документа, подтверждающего соответствие юридических лиц, индивидуальных предпринимателей, осуществляющих техническое обслуживание гражданских воздушных судов, требованиям федеральных авиационных правил».
Система менеджмента качества НПО «Наука» сертифицирована на соответствие требованиям ГОСТ Р ИСО 9001-2015, ГОСТ Р 58876-2020, ГОСТ РВ 0015-002-2020 и других государственных военных стандартов СРПП ВТ, Положений РК-98, РК-11, ОСТ 134-1028-2012.
Для обеспечения соответствия требованиям высочайших стандартов НПО «Наука» внедрило процессный подход к управлению, в основе которого лежит выделение в компании системы бизнес-процессов и управление этими процессами.
Непрерывный мониторинг и совершенствование процессов позволяет строить эффективную систему управления, направленную на выполнение задач компании и достижение успеха во внешней среде.